单细胞测序数据分析人外周血NK细胞糖酵解相关基因表达差异

2020.09.13点击:

摘要: 目的:分析人外周血自然杀伤细胞(NK细胞)不同亚群糖酵解相关基因表达差异,揭示人外周血自然杀伤细胞亚群代谢差异.方法:选择GEO数据库中人外周血NK细胞单细胞测序数据作为分析对象,采用R语言seurat包对数据进行过滤、归一化、主成分分析(PCA)、t-SNE聚类分析,寻找自然杀伤细胞亚群;通过差异基因表达分析确定不同NK细胞亚群的特征基因;进一步分析不同NK细胞亚群糖酵解相关基因表达水平.结果:单细胞测序数据分析表明,人外周血NK细胞能够分成两个不同的亚群,其中一群NK细胞高表达颗粒酶B、穿孔素和CD16,提示该群NK细胞具有较强细胞杀伤功能,与成熟NK细胞类似.而另外一群NK细胞高表达XCL1、CD44、CD74、LTB、FOS,低表达颗粒酶B、穿孔素和CD16,提示其细胞杀伤功能弱,与未成熟NK细胞类似.进一步分析表明,成熟NK细胞糖酵解相关基因PGAM1表达水平高于未成熟NK细胞.结论:人外周血NK细胞包括两个不同的亚群,不同NK细胞亚群糖酵解相关基因表达不同,未成熟的NK细胞表达更高水平的糖酵解相关基因,具体的机制及意义仍需进一步探讨.

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关键词:

自然杀伤细胞  单细胞测序  代谢免疫  糖酵解

作者:

杨颖

Author:

Yang Ying

作者单位:

山东第一医科大学药学院 山东 泰安 271000

刊名:

养生保健指南

Journal:

Health Guide

年,卷(期):

2020, (11)

所属期刊栏目:

论著

分类号:

R

在线出版日期:

2020-08-27 (万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

页数:

共2页

页码:

9-10